Orologio di replicazione del Mycobacterium tuberculosis

Esistono pochi strumenti per valutare la replicazione dei patogeni cronici durante l’infezione. Questo è stato un serio ostacolo alla comprensione della tubercolosi latente e gli sforzi per sviluppare nuove terapie generalmente presuppongono che   i batteri   si replichino molto lentamente o non si replichino durante il periodo di latenza.

• Per monitorare la replicazione del Mycobacterium tuberculosis nell’ospite, utilizziamo un plasmide instabile che viene perso a una velocità costante e   misurabile   dalle cellule in divisione in assenza di selezione di antibiotici.
• Utilizzando un modello matematico, calcoliamo la crescita batterica e i tassi di mortalità  quando i topi vengono infettati.
• Mostriamo che durante l’infezione cronica, la  carica batterica cumulativa   , enumerando il totale degli organismi viventi, morti ed eliminati incontrati dal polmone del topo, è significativamente superiore a quella stimata per le unità formanti colonie.
• I nostri dati mostrano che M. tuberculosis si riproduce nel corso dell’infezione cronica nei topi ed è inibito dal sistema immunitario dell’ospite. Questo approccio potrebbe anche far luce sulla dinamica della replicazione di altri agenti patogeni cronici.

Batteri del pannello per quantificare la polmonite

I batteri   utilizzano sistemi di coniugazione, una sottofamiglia di sistemi secretori di tipo IV, per trasportare il DNA nelle cellule riceventi. Nonostante 50 anni di ricerca, l’architettura e il meccanismo del canale che media il trasferimento del DNA attraverso l’  involucro cellulare batterico   rimangono poco chiari. Utilizzando un test sensibile e   quantificabile   chiamato DNA transfer immunoprecipitation (TrIP), identifichiamo i contatti tra il substrato del DNA (T-DNA) e 6 dei 12 componenti del sistema di coniugazione Agrobacterium tumefaciens phytopathogen VirB / D4. I nostri risultati definiscono la via di traslocazione del substrato di DNA attraverso   la macchina di coniugazione batterica   , determinando il contributo di ciascuna subunità dell’apparato secretorio al passaggio del substrato.

Batteri mucosi e invasivi  nei pazienti con IBD rispetto al gruppo di controllo.

• Si sospetta che batteri intestinali endogeni    e/o  patogeni batterici specifici   siano coinvolti nella patogenesi della malattia infiammatoria intestinale (IBD). Lo scopo di questo studio era di testare i tessuti IBD per diversi gruppi di  popolazioni batteriche che   hanno una superficie mucosa e/o si infiltrano nella mucosa.
• Sezioni di tessuto da resezioni chirurgiche dell’ileo terminale e/o del colon di 24 pazienti con IBD (12 colite ulcerosa attiva (UC), 12 morbo di Crohn (CD) attiva) e 14 controlli non-IBD sono stati testati mediante ibridazione in situ fluorescente su un base misurabile.
•  Sono stati rilevati più batteri sulla mucosa dei pazienti con IBD  rispetto al gruppo di controllo senza IBD (P <0,05). L’invasione batterica della mucosa è stata osservata nell’83,3% dei campioni del colon di pazienti con CU, nel 55,6% dell’ileo e nel 25% dei campioni del colon di pazienti con CD, ma non  sono stati rilevati batteri nei tessuti di controllo.
• I campioni di colon UC sono stati colonizzati da vari organismi come   batteri   appartenenti al sottogruppo gamma  dei batteri Proteo  , batteri Enteroceae  , Bacteroides / Prevotella cluster, Clostridium histolyticum / Clostridium lituseburense group, Clostridium coccides / Eubacterium rectale group, batteri alti G + C Gram-positivi o  batteri  riducenti i solfati   ,  mentre i campioni di CD contenevano principalmente   batteri  appartenenti ai primi tre gruppi.
• Gli eventi patogeni in CD e CU possono essere associati a una varietà di cambiamenti nella flora mucosa dell’ileo e del colon.

Dove la microbiologia incontra la microingegneria: design e applicazioni   dei batteri reporter.

I batteri   sono stati a lungo l’obiettivo della manipolazione genetica, ma recentemente sono stati ingegnerizzati sinteticamente per svolgere compiti specifici. Uno dei più semplici di questi compiti è il rilevamento di sostanze chimiche e tossicità in combinazione con la produzione di   un segnale misurabile del   reporter. In questa recensione, descriviamo l’attuale progettazione di bioreporter  batterici   e il loro utilizzo in una serie di test per misurare la presenza di sostanze chimiche nocive in acqua, aria, suolo, cibo o campioni biologici. Ha inoltre evidenziato le nuove tendenze nell’integrazione della biologia sintetica e della microingegneria con la progettazione di piattaforme di bioreporter batterici  .

Discrepanza quantitativa del microbiota della   radice batterica   nei parenti di Arabidopsis thaliana.

Le piante si nutrono nella zona di contatto con il suolo con il caratteristico  microbiota batterico associato alle radici  che si ritiene funzioni nella nutrizione e nella salute delle piante. Abbiamo esaminato la diversità della microflora della radice all’interno degli ospiti filogenetici: tre

1. Ecotipi di Arabidopsis thaliana con specie sorelle Arabidopsis halleri e Arabidopsis lyrata e Cardamine hirsuta, che differivano dalla precedente – 35 Mya.
2. Abbiamo esaminato il loro microbiota in condizioni ambientali controllate e A. thaliana e C. hirsuta in due habitat naturali. La profilazione profonda dei geni 16S rRNA delle radici e dei relativi campioni di suolo ha identificato un totale di 237   ribotipi   batterici misurabili   , di cui una media di 73 membri della comunità erano arricchiti con radici.
3. La composizione di questa microflora radicale dipende più dall’interazione con l’ambiente che con le specie ospiti. La diversità della microflora delle specie tra gli ospiti è in gran parte quantitativa ed è maggiore tra i tre
4. Arabidopsis rispetto ai tre ecotipi di A. thaliana. Il microbiota specifico della specie ospite è stato identificato a livello di singoli membri della comunità, gruppi tassonomici e intere comunità radicali.
5. La maggior parte di queste firme è stata osservata in C. hirsuta filogeneticamente distante. Tuttavia, l’ordine di ramificazione della filogenesi dell’ospite non è coerente con la diversità interspecifica della microflora della radice, indicando che la distanza filogenetica dell’ospite da sola non può spiegare la diversità della microflora della radice.
6. Il nostro lavoro rivela entro 35 milioni di anni dalla discrepanza dell’ospite un microbiota di radici ampiamente conservato e tassonomicamente stretto che include membri stabili della comunità appartenenti ad  Actinomycetales, Burkholderiales e Flavo.

DNA extracellulare in biofilm insaturi mono e multispecie.

1. Le sostanze polimeriche extracellulari (EPS) dei  biofilm batterici   creano una barriera idratata tra le cellule e il loro ambiente esterno. Una migliore caratterizzazione dell’EPS può essere utile per comprendere la fisiologia del biofilm.
2. L’EPS è chimicamente complesso e varia sia con il  ceppo batterico  che con le condizioni di crescita.
3. In precedenza abbiamo riportato che il biofilm EPS insaturo di Pseudomonas aeruginosa contiene grandi quantità di DNA extracellulare (eDNA) (RE Steinberger, AR Allen, HG Hansma e PA Holden, Microb. Ecol. 43: 416-423, 2002).
4. Qui abbiamo esaminato la somiglianza costitutiva dell’eDNA con il DNA cellulare, la  quantità relativa di eDNA e il profilo sociale del polimorfismo della lunghezza del frammento di restrizione dell’eDNA (TRFLP) nei biofilm multispecie. L’analisi del DNA polimorfico amplificato in modo casuale ha mostrato  che il DNA cellulare e l’eDNA sono identici ai biofilm di P. aeruginosa.
5. Significativamente più eDNA è stato prodotto nei biofilm di P. aeruginosa e Pseudomonas putida rispetto ai biofilm di Rhodococcus erythropolis o Variovorax paradoxus.
6. Sebbene la quantità di eDNA nei biofilm a doppia specie fosse dello stesso ordine di grandezza di quella nei biofilm a singola specie, le quantità non erano prevedibili da misurazioni di singolo ceppo.
7. Sulla base dello Shannon Diversity Index e dell’analisi dei principali componenti dei profili TRFLP generati dai geni 16S rRNA, l’eDNA dei biofilm delle quattro specie differiva significativamente dal DNA cellulare o totale dello stesso biofilm.

Gram + bacteria
3802	Virostat	100 ug	270 EUR
Gram + bacteria
3803	Virostat	100 ug	270 EUR
Gram + bacteria
3804	Virostat	each	270 EUR
Gram + bacteria
3811	Virostat	100 ug	270 EUR
Bacterial Vaginosis Real-TM Quant Multiplex RT-PCR for quantitative detection of G. vaginalis, Atopobium vaginae, Lactobacillus spp. and total bacteriae in the vaginal biotope
B74-100FRT	Sacace Biotechnologies	100	1414.82 EUR
pgRNA- bacteria
PVT10642	Lifescience Market	2 ug	361.2 EUR
Human Anti-Mycoplasma Pneumoniae (Mp) IgA ELISA Kit, 96 tests, quantitative
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Human Anti-Mycoplasma Pneumoniae (Mp) IgG ELISA Kit, 96 tests, quantitative
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Human Anti-Mycoplasma Pneumoniae (Mp) IgM ELISA Kit, 96 tests, quantitative
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Aerobic Bacteria
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Methane Bacteria
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pwtCas9- bacteria
PVT10641	Lifescience Market	2 ug	361.2 EUR
Anaerobic Bacteria
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Nitrifying bacteria
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cDNA - Pneumonia: Lung
C1236152Ld-4	Biochain	40 reactions	726.6 EUR
Denitrifying bacteria
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Methane Bacteria 2
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Aerobic Bacteria 2
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Chlamydia Pneumonia Protein
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Chlamydia Pneumonia Protein
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Chlamydia Pneumonia Protein
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Chlamydia Pneumonia Protein
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Chlamydia Pneumonia Protein
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Chlamydia Pneumonia Protein
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Deodorant bacteria 2
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Bacteria Lysing Agent
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Mycoplasma pneumonia protein
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COD Degrading Bacteria
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Nitrifying Bacteria 2
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COD Degrading Bacteria
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Gram positive bacteria
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Gram positive bacteria
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Gram positive (+) bacteria
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Gram positive (+) bacteria
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Gram positive bacteria
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Gram positive bacteria
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Gram positive bacteria
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Gram positive bacteria
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pdCas9- Bacteria Plasmid
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Pneumonia virus of mice
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Pneumonia virus of mice
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Pneumonia virus of mice
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Pneumonia virus of mice
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Pneumonia virus of mice
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Recombinant Chlamydia Pneumonia
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Recombinant Chlamydia Pneumonia
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Recombinant Chlamydia Pneumonia
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Recombinant Chlamydia Pneumonia
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Recombinant Chlamydia Pneumonia
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Recombinant Chlamydia Pneumonia
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Recombinant Chlamydia Pneumonia
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Chlamydia Pneumonia Recombinant
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Denitrifying bacteria 2
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Denitrifying bacteria 3
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Sludge Digestion Bacteria
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Complex nitrifying bacteria
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Complex biological bacteria
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Phosphorus Remover Bacteria
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Chlamydia Pneumonia IgG ELISA
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Chlamydia Pneumonia IgA ELISA
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Chlamydia Pneumonia IgM ELISA
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Chlamydia pneumonia IgA ELISA
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Chlamydia pneumonia IgG ELISA
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Chlamydia pneumonia IgM ELISA
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Chlamydia IgG (Pneumonia) ELISA
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Chlamydia IgG (Pneumonia) ELISA
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Chlamydia IgM (Pneumonia) ELISA
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Chlamydia IgM (Pneumonia) ELISA
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Chlamydia IgA (Pneumonia) ELISA
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Chlamydia IgA (Pneumonia) ELISA
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Chlamydia pneumonia IgA ELISA
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Chlamydia pneumonia IgA ELISA
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Chlamydia pneumonia IgG ELISA
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Chlamydia pneumonia IgG ELISA
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Chlamydia pneumonia IgM ELISA
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Chlamydia pneumonia IgM ELISA
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Bacteria Genomic DNA Kit
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Bacteria Genomic DNA Kit
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Bacteria Genomic DNA Kit
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Bacteria Genomic DNA Kit
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Mycoplasma Pneumonia IgG ELISA
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Mycoplasma Pneumonia IgM ELISA
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Bacteria lysing CK01 - PK50
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Bacteria RNA Plus Reagent
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Mycoplasma pneumonia P1 protein
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Mycoplasma pneumonia P1 protein
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Mycoplasma pneumonia P1 protein
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Native Bacteria Achromopeptidase
NATE-0022	Creative Enzymes	1g	570 EUR
Mycoplasma pneumonia P116 protein
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Mycoplasma pneumonia P116 protein
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Mycoplasma pneumonia P116 protein
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genesigPLEX Atypical Pneumonia Kit
R01001	Novacyt Group	100 tests	1777 EUR
BACTERIA SCREENING MEDIUM 523
B129	PhytoTechnology Laboratories	100G	70.55 EUR
NOCIVE BREWERS BACTERIA AGAR
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NOCIVE BREWERS BACTERIA AGAR
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NOCIVE BREWERS BACTERIA AGAR
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Bacteria for biological filter
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Complex biological bacteria 2
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Native Pneumonia Virus of Mice
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Pneumonia virus of Mice protein
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Pneumonia virus of Mice protein
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Pneumonia virus of Mice protein
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Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
abx021740-80l	Abbexa	80 µl	1150 EUR
Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram positive bacteria, Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
GWB-6D0DCC	GenWay Biotech	0.1 mg	Ask for price
Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
MBS5310939-5x1mg	MyBiosource	5x1mg	4070 EUR
Gram Positive Bacteria Antibody
MBS5310940-1mg	MyBiosource	1mg	720 EUR
Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
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Gram Positive Bacteria Antibody
MBS5310941-5x1mg	MyBiosource	5x1mg	3095 EUR
Acid Fast Bacteria Stain Kit
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Acid Fast Bacteria Stain Kit
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QPCR Kit DNA Bacteria Domain
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Necrotizing hepatopancreatitis bacteria
PCR-V281-PCRV28148D	Bioingentech	PCR-V281-48D	230 EUR
Necrotizing hepatopancreatitis bacteria
PCR-V281-PCRV28196D	Bioingentech	PCR-V281-96D	312 EUR
Necrotizing hepatopancreatitis bacteria
Oneq-V281-OneqV281100D	Bioingentech	Oneq-V281-100D	515 EUR
Necrotizing hepatopancreatitis bacteria
Oneq-V281-OneqV281150D	Bioingentech	Oneq-V281-150D	594 EUR
Necrotizing hepatopancreatitis bacteria
Oneq-V281-OneqV28150D	Bioingentech	Oneq-V281-50D	413 EUR
Chlamydia pneumonia IgG ELISA Kit
MBS580093-5x96StripWells	MyBiosource	5x96-Strip-Wells	1440 EUR
Chlamydia pneumonia IgG ELISA Kit
MBS580093-96StripWells	MyBiosource	96-Strip-Wells	330 EUR
Chlamydia pneumonia IgM ELISA Kit
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Chlamydia pneumonia IgM ELISA Kit
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Chlamydia pneumonia IgA ELISA Kit
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Chlamydia pneumonia IgA ELISA Kit
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Recombinant Mycoplasma pneumonia antigen
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Recombinant Mycoplasma pneumonia antigen
MBS5308834-5x1mg	MyBiosource	5x1mg	1115 EUR
Lactic Bacteria Differential Agar
68888	Sisco Laboratories	100 Gms	9.41 EUR
Lactic Bacteria Differential Agar
68888-1	Sisco Laboratories	500 Gms	35.92 EUR
Lactic Bacteria Differential Agar
M1087-500G	EWC Diagnostics	1 unit	43.37 EUR
Maltose Phosphorylase (MP (Bacteria))
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Maltose Phosphorylase (MP (Bacteria))
MBS682062-1000Units	MyBiosource	1000Units	350 EUR
Maltose Phosphorylase (MP (Bacteria))
MBS682122-250Units	MyBiosource	250Units	305 EUR
AFS.22HF BACTERIA FILTER - EACH
HFBCTFAFS	Scientific Laboratory Supplies	EACH	289.35 EUR
MAb to Gram Positive Bacteria
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MAb to Gram Positive Bacteria
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MAb to Gram Positive Bacteria
MBS310317-1mg	MyBiosource	1mg	915 EUR
MAb to Gram Positive Bacteria
MBS310317-5x1mg	MyBiosource	5x1mg	3945 EUR
RNApure Bacteria Kit (DNase I)
MBS278037-50Preps	MyBiosource	50Preps	310 EUR
Psychrophilic Bacteria Count Plate
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Lactic Bacteria Differential Broth
M1086-500G	EWC Diagnostics	1 unit	41.3 EUR
Mbead Bacteria Genomic DNA Kit
PDM03-0100	Bio-Helix	100 rxns	154 EUR
Monoclonal antibody to C. Pneumonia
MBS596241-INQUIRE	MyBiosource	INQUIRE	Ask for price
Monoclonal antibody to M. Pneumonia
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Monoclonal antibody to M. Pneumonia
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Monoclonal antibody to M. Pneumonia
MBS596277-5mg	MyBiosource	5mg	1505 EUR
Pneumonia Virus (PVM) ELISA Microplate
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Pneumonia Virus (PVM) ELISA Microplate
MBS412116-5x48AntigenWells5x48ControlAntigenWells	MyBiosource	5x48AntigenWells&5x48ControlAntigenWells	1080 EUR
Rat Pneumonia Virus Positive Control
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Rat Pneumonia Virus Positive Control
MBS412129-5x1mL	MyBiosource	5x1mL	645 EUR
QPCR Kit DNA Bacteria DomaiMmix
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S. pneumonia MurC - for 100 assays
MURC-100SP	ProFoldin	100 assays	337.25 EUR
S. pneumonia MurF - for 100 assays
MURF-100SP	ProFoldin	100 assays	337.25 EUR
Pneumonia virus of mice PCR kit
PCR-V384-48R	Bioingentech	50T	987.6 EUR
Pneumonia virus of mice PCR kit
PCR-V384-96R	Bioingentech	100T	1335.6 EUR
S. pneumonia PncB - for 100 assays
PNCB-100SP	ProFoldin	100 assays	337.25 EUR
Chlamydia pneumonia antigen (VD2-VD3)
MBS596104-1mg	MyBiosource	1mg	425 EUR
Chlamydia pneumonia antigen (VD2-VD3)
MBS596104-2mg	MyBiosource	2mg	700 EUR
Chlamydia pneumonia antigen (VD2-VD3)
MBS596104-5mg	MyBiosource	5mg	1505 EUR
Bacteria lysing CK01-15mL - PK25
HOM1096	Scientific Laboratory Supplies	PK25	257.85 EUR
Lactic Acid Bacteria Count Plate
KGR014	Ring Biotechnology Co	12tests	24 EUR
Rat pneumonia virus (PV) ELISA Kit
SL1018Ra	Sunlong	-	498 EUR
Mouse Pneumonia Virus Positive Control
MBS412106-1mL	MyBiosource	1mL	175 EUR
Mouse Pneumonia Virus Positive Control
MBS412106-5x1mL	MyBiosource	5x1mL	645 EUR
Rat Pneumonia Virus,PVM ELISA KIT
JOT-EKD0065Ra	Jotbody	96 wells	366.4 EUR
Rat Pneumonia Virus,PVM ELISA KIT
ED0065Ra	Jiaxing Korain Biotech Ltd (BT Labs)	96 wells	458 EUR
ELISA kit for Rat Pneumonia virus
KTE101139-48T	Abbkine	48T	424.8 EUR
ELISA kit for Rat Pneumonia virus
KTE101139-5platesof96wells	Abbkine	5 plates of 96 wells	2702.4 EUR
ELISA kit for Rat Pneumonia virus
KTE101139-96T	Abbkine	96T	686.4 EUR
Rat Pneumonia Virus, PVM ELISA Kit
MBS1610427-10x96StripWells	MyBiosource	10x96-Strip-Wells	3955 EUR
Rat Pneumonia Virus, PVM ELISA Kit
MBS1610427-5x96StripWells	MyBiosource	5x96-Strip-Wells	2005 EUR
Rat Pneumonia Virus, PVM ELISA Kit
MBS1610427-96StripWells	MyBiosource	96-Strip-Wells	475 EUR
Acid Fast Bacteria Control Slides
HCS1001-25	ScyTek Laboratories	25 Slides	137.81 EUR
Rabbit Pneumonia Virus Positive Control
MBS412176-1mL	MyBiosource	1mL	175 EUR
Rabbit Pneumonia Virus Positive Control
MBS412176-5x1mL	MyBiosource	5x1mL	645 EUR
Direct DNA Extraction Kit (Bacteria)
61500	Norgen Biotek Corp	50 Preps	53.4 EUR
Isolation Medium For Iron Bacteria
M622-100G	EWC Diagnostics	1 unit	14.77 EUR
Isolation Medium For Iron Bacteria
M622-500G	EWC Diagnostics	1 unit	43.27 EUR

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Tuttavia, le analisi TRFLP basate sul DNA totale e sul DNA cellulare di questa comunità di biofilm hanno fornito risultati identici. Concludiamo che la produzione di DNA extracellulare nei biofilm insaturi dipende dalla specie e che le informazioni filogenetiche contenute in questo pool di DNA sono   numerabili   e diverse dal DNA totale o cellulare.